配对交易的特性之一是它的市场中性(和大盘走势的相关度较低)，在整个市场无明显趋势性机会时，可以通过配对交易避免股市系统风险的影响，获取Alpha绝对收益。
配对交易需要股票市场做空机制的支持，目前国内大型券商都在积极开展融资融券业务,截至2011年6月3日，沪深两市融资余额达到259.04亿元，日均融资买入额为8.59亿元;融券余额1.61亿元，日均融券卖出额为0.64亿元。市场交易仍以融资买入为主，融券业务受到券商持券品种与数量的限制，量相对较小。配对交易策略当前只适合一些小资金操作，不过随着参与者的增多及后续转融通业务的启动，市场容量将会逐步扩大。
基金公司、保险等机构投资者目前尚未批准参与融资融券业务，但是可以利用配对交易的原理，将手头持有的股票和市场上适合与之配对的股票进行阶段性替换，以实现组合收益的加强，该方法尤其适合指数加强型产品。
