用户直接将还款资金存入支付宝助学账户中，到了还款日系统会自动扣款用于还款。或者用户登录支付宝的电脑端，在应用中心进行助学贷款还款，之后会有页面提示告知用户如何还款，按照提示操作用户就可以正常还款。用户还款后，月末才会显示已还款，请在月末查询还款状态。
助学贷款没有按时还款会产生逾期记录与逾期利息，其中逾期记录会严重影响个人征信，逾期利息则会加重用户的还款负担。而且由于助学贷款是在校期间财政贴息的贷款，因此助学贷款逾期，产生的负面影响要比其他贷款逾期的负面影响更大。
助学贷款使用支付宝还款非常方便，一旦出现逾期，后续也可以使用支付宝还款。只要每期都按时还款，用户就可以积累良好的信用记录。
